Chercheur

    Mark E. Samuels , Ph.D.

    mark.e.samuels@umontreal.ca
    Mark E. Samuels
    Axe de recherche
    Santé métabolique et maladies complexes
    Thème de recherche
    Maladies génétiques et métaboliques au Québec : diagnostics, mécanismes et interventions
    Adresse
    CHUSJ - Centre de Recherche

    Téléphone
    514 345-4931 #4265

    Fax
    514 345-4801

    Sommaire de carrière

    Au cours de ma carrière, j'ai étudié les mécanismes biochimiques de l'expression des gènes de mammifères, la génétique du développement de la drosophile ainsi que la génétique humaine. Présentement, je poursuis mon travail de recherche dans l'analyse génétique du génome humain.

    Sur les 20 000 à 25 000 gènes codants estimés dans le génome humain, il y en a moins de 3 000 pour lesquels des mutations sont associées à un phénotype. La fonction de la grande majorité des gènes reste donc encore inconnue. Je m'intéresse à cette question en utilisant la cartographie génétique et la séquençage à haut débit de détection des mutations basé sur une définition rigoureuse des paramètres phénotypiques décrivant de nouveaux états de maladies. Grâce au financement de Génome Canada, j’ai dirigé une étude sur les maladies monogéniques touchant la population des provinces de l'Atlantique avec la découverte de nouveaux gènes. Cette région est utile pour ce genre de recherche grâce aux effets multiples fondateurs basés sur l’ethnicité (comme les acadiens) et la géographie (comme l’Isle Prince Edward). Le projet a permit la découverte de 10 nouveaux gènes dans lesquelles des mutations donnent des désordres du cerveau, du sang et du peau parmis d’autre organes.

    Cependant, l'établissement de cartes de liaison génétique à l'échelle du génome entier exige un nombre minimal de familles de taille suffisante afin d'atteindre un bon pouvoir statistique. Les nouvelles technologies de séquençage génomique ou exomique ont permit l’étude de désordres génétiques avec des cohortes de patients non-reliés. Nous avons employé ces technologies, et nous avons récemment découvert plusieurs nouveaux gènes incluant un gène pour une sorte d’ostéoporose. Ces développements technologiques associés aux données cliniques (confirmation de diagnostic) issues du CHU Sainte-Justine affilié à l'Université de Montréal nous permettront d'identifier les causes de plusieurs autres maladies génétiques, y compris des désordres du système endocrine central (la pituitaire).

    Mon laboratoire effectue également des études fonctionnelles sur les gènes les plus prometteurs identifiés par liaison génétique afin de développer de nouvelles approches thérapeutiques pour des pathologies sévères. Le gène UBIAD1 est muté dans une forme rare de dystrophie cornéenne. UBIAD1 est impliqué dans le transport intracellulaire du cholestérol et la biosynthèse de vitamine K. Donc ce gène pourrait offrir une nouvelle approche dans le contrôle du niveau systémique des lipides afin de réduire le risque de maladie coronarienne.

    Prix et distinctions

    • US Presidential Scholar Phi Beta Kappa Sigma XI.

Publications

Hajdu-Cheney syndrome: phenotypical progression with de-novo NOTCH2 mutation - Descartes M, Rojnueangnit K, Cole L, Sutton A, Morgan SL, Patry L, Samuels ME. Hajdu-Cheney syndrome: phenotypical progression with de-novo NOTCH2 mutation. Clin Dysmorphol 2014; (sous presse).

Recessive TTN truncating mutations define novel forms of core myopathy with heart disease - Chauveau C, Bonnemann CG, Julien C, Kho AL, Marks H, Talim B, Maury P, Arne-Bes MC, Uro-Coste E, Alexandrovich A, Vihola A, Schafer S, Kaufmann B, Medne L, Hübner N, Foley AR, Santi M, Udd B, Topaloglu H, Moore SA, Gotthardt M, Samuels ME, Gautel M, Ferreiro A. Recessive TTN truncating mutations define novel forms of core myopathy with heart disease. Hum Mol Genet 2014; 23(4): 980-991.

Bioinactive ACTH causing glucocorticoid deficiency - Samuels ME, Gallo-Payet N, Pinard S, Hasselmann C, Magne F, Patry L, Chouinard L, Schwartzentruber JA, René P, Sawyer N, Bouvier M, Djemli A, Delvin EE, Huot C, Eugène D, Deal C, Van Vliet G, Majewski J, Deladoëy J, FORGE Canada Consortium. Bioinactive ACTH causing glucocorticoid deficiency. J Clin Endocrinol Metab 2013; 98(2): 736-742.

Exome sequencing identifies mutations in the gene TTC7A in French-Canadian cases with hereditary multiple intestinal atresia - Samuels ME, Majewski J, Aljazaeri A, Fernandez I, Casals F, Patey N, Decaluwé H, Gosselin I, Haddad E, Hodgkinson A, Idaghdour Y, Marchand V, Michaud JL, Rodrigue MA, Desjardins S, Dubois S, Le Deist F, Awadalla P, Raymond V, Maranda B. Exome sequencing identifies mutations in the gene TTC7A in French-Canadian cases with hereditary multiple intestinal atresia. J Med Genet 2013; 50(5): 324-329.

Whole exome sequencing: opportunities in pediatric endocrinology - Samuels ME, Hasselmann C, Deal C, Deladoëy J, Van Vliet G. Whole exome sequencing: opportunities in pediatric endocrinology. Personalized Med 2013; (sous presse).

Disruption of TBC1D7, a subunit of the TSC1-TSC2 protein complex, in intellectual disability and megalencephaly - Capo-Chichi JM, Tcherkezian J, Hamdan F, Décarie JC, Dobrzeniecka S, Patry L, Nadon MA, Mucha BE, Major P, Shevell MI, Ouled Amar Bencheikh B, Joober R, Samuels ME, Rouleau GA, Roux P, Michaud JL. Disruption of TBC1D7, a subunit of the TSC1-TSC2 protein complex, in intellectual disability and megalencephaly. J Med Genet 2013; 50(11): 740-744.

Mutations in PIK3R1 cause SHORT syndrome - Dyment DA, Smith A, Alcantara D, Schwartzentruber JA, Basel-Vanagaite L, Curry CJ, Temple IK, Reardon W, Mansour S, Haq MR, Gilbert R, Lehmann OJ, Vanstone CA, Beaulieu C, FORGE Canada Consortium, Majewski J, Bulman DE, O'Driscoll M, Boycott KM, Innes AM, Friedman J, Michaud JL, Bernier F, Brudno M, Fernandez B, Knoppers B, Samuels ME, Scherer S. Mutations in PIK3R1 cause SHORT syndrome. Am J Hum Genet 2013; 93(1): 158-166.

Loss of the E3 ubiquitin ligase LRSAM1 sensitizes peripheral axons to degeneration in a mouse model of Charcot-Marie-Tooth disease - Bogdanik LP, Sleigh JN, Tian C, Samuels ME, Bédard K, Seburn KL, Burgess RW. Loss of the E3 ubiquitin ligase LRSAM1 sensitizes peripheral axons to degeneration in a mouse model of Charcot-Marie-Tooth disease. Dis Model Mech 2013; 6(3): 780-792.

A novel rearrangement of occludin causes brain calcification and renal dysfunction - LeBlanc M, Penney LS, Gaston D, Shi Y, Aberg E, Nightingale M, Jiang H, Gillett R, Fahiminiya S, Macgillivray C, Wood EP, Acott PD, Khan MN, Samuels ME, Majewski J, Orr A, McMaster CR, Bédard K. A novel rearrangement of occludin causes brain calcification and renal dysfunction. Hum Genet 2013; 132(11): 1223-1234.

Deficiency of asparagine synthetase causes congenital microcephaly and a progressive form of encephalopathy - Ruzzo EK, Capo-Chichi JM, Ben-Zeev B, Chitayat D, Mao H, Pappas AL, Hitomi Y, Lu YF, Yao X, Hamdan F, Pelak K, Reznik-Wolf H, Bar-Joseph I, Oz-Levi D, Lev D, Lerman-Sagie T, Leshinsky-Silver E, Anikster Y, Ben-Asher E, Olender T, Colleaux L, Décarie JC, Blaser S, Banwell B, Joshi RB, He XP, Patry L, Silver RJ, Dobrzeniecka S, Islam S, Hasnat A, Samuels ME, Aryal DK, Rodriguiz RM, Jiang YH, Wetsel WC, McNamara JO, Rouleau GA, Silver DL, Lancet D, Pras E, Mitchell GA, Michaud JL, Goldstein DB. Deficiency of asparagine synthetase causes congenital microcephaly and a progressive form of encephalopathy. Neuron 2013; 80(2): 429-441.

Identification and biochemical characterization of a novel mutation in DDX11 causing warsaw breakage syndrome - Capo-Chichi JM, Bharti SK, Sommers JA, Yammine T, Chouery E, Patry L, Rouleau GA, Samuels ME, Hamdan F, Michaud JL, Brosh Jr RM, Megarbane A, Kibar Z. Identification and biochemical characterization of a novel mutation in DDX11 causing warsaw breakage syndrome. Hum Mutat 2013; 34(1): 103-107.

A generalizable pre-clinical research approach for orphan disease therapy - Beaulieu C, Samuels ME, Ekins S, McMaster CR, Edwards AM, Krainer AR, Hicks GG, Frey BJ, Boycott KM, Mackenzie AE. A generalizable pre-clinical research approach for orphan disease therapy. Orphanet J Rare Dis 2012; 7: 39.

Bisphosphonate therapy for painless fracture: change of HSAN 1 clinical course with biphosphonate and Vitamin D therapy - Marík IA, Marikova A, Hudakova O, Samuels ME, Kozlowski KS. Bisphosphonate therapy for painless fracture: change of HSAN 1 clinical course with biphosphonate and Vitamin D therapy. J Musculoskelet Neuronal Interact 2012; 12(3): 165-173.

Meier-Gorlin syndrome genotype-phenotype studies: 35 individuals with pre-replication complex gene mutations and 10 without molecular diagnosis - de Munnik SA, Bicknell LS, Aftimos S, Al-Aama J, van Bever Y, Bober M, Clayton-Smith J, Edrees AY, Feingold M, Fryer A, Van Hagen JM, Hennekam RC, Jansweijer MC, Johnson D, Kant SG, Opitz JM, Ramadevi AR, Reardon W, Ross A, Sarda P, Schrander-Stumpel CT, Schoots J, Temple IK, Terhal PA, Toutain A, Wise CA, Wright M, Skidmore D, Samuels ME, Hoefsloot LH, Knoers NV, Brunner HG, Jackson AP, Bongers EM. Meier-Gorlin syndrome genotype-phenotype studies: 35 individuals with pre-replication complex gene mutations and 10 without molecular diagnosis. Eur J Hum Genet 2012; 20(6): 598-606.

Mutations in C5ORF42 cause Joubert syndrome in the French Canadian population - Srour M, Schwartzentruber JA, Hamdan F, Ospina LH, Patry L, Labuda D, Massicotte C, Dobrzeniecka S, Capo-Chichi JM, Papillon-Cavanagh S, Samuels ME, Shevell MI, Laframboise R, Desilets V, FORGE Canada Consortium, Maranda B, Rouleau GA, Majewski J, Michaud JL. Mutations in C5ORF42 cause Joubert syndrome in the French Canadian population. Am J Hum Genet 2012; 90(4): 693-700.

Haploinsufficiency of SF3B4, a component of the pre-mRNA spliceosomal complex, causes Nager syndrome - Bernier FP, Caluseriu O, Ng S, Schwartzentruber JA, Buckingham KJ, Innes AM, Jabs EW, Innis JW, Schuette JL, Gorski JL, Byers PH, Andelfinger G, Siu V, Lauzon J, Fernandez BA, McMillin M, Scott RH, Racher H, FORGE Canada Consortium, Majewski J, Nickerson DA, Shendure J, Bamshad MJ, Parboosingh J, Boycott KM, Friedman J, Michaud JL, Bernier F, Brudno M, Fernandez B, Knoppers B, Samuels ME, Scherer S. Haploinsufficiency of SF3B4, a component of the pre-mRNA spliceosomal complex, causes Nager syndrome. Am J Hum Genet 2012; 90(5): 925-933.

Meier-Gorlin syndrome: growth and secondary sexual development of a microcephalic primordial dwarfism disorder - de Munnik SA, Otten BJ, Schoots J, Bicknell LS, Aftimos S, Al-Aama J, van Bever Y, Bober M, Born GF, Clayton-Smith J, Deal C, Edrees AY, Feingold M, Fryer A, Van Hagen JM, Hennekam RC, Jansweijer MC, Johnson D, Kant SG, Opitz JM, Ramadevi AR, Reardon W, Ross A, Sarda P, Schrander-Stumpel CT, Sluiter AE, Temple IK, Terhal PA, Toutain A, Wise CA, Wright M, Skidmore D, Samuels ME, Hoefsloot LH, Knoers NV, Brunner HG, Jackson AP, Bongers EM. Meier-Gorlin syndrome: growth and secondary sexual development of a microcephalic primordial dwarfism disorder. Am J Med Genet A 2012; 158A(11): 2733-2742.

46, XY gonadal dysgenesis: new SRY point mutation in two siblings with paternal germ line mosaicism - Stoppa-Vaucher S, Ayabe T, Paquette J, Patey N, Francoeur D, Vuissoz JM, Deladoëy J, Samuels ME, Ogata K, Deal C. 46, XY gonadal dysgenesis: new SRY point mutation in two siblings with paternal germ line mosaicism. Clin Genet 2012; 82(6): 505-513.

Mutations in origin recognition complex gene ORC4 cause Meier-Gorlin syndrome - Guernsey DL, Matsuoka M, Jiang H, Evans S, Macgillivray C, Nightingale M, Perry S, Ferguson M, LeBlanc M, Paquette J, Patry L, Rideout A, Thomas A, Orr A, McMaster CR, Michaud JL, Deal C, Langlois S, Superneau DW, Parkash S, Ludman M, Skidmore D, Samuels ME. Mutations in origin recognition complex gene ORC4 cause Meier-Gorlin syndrome. Nat Genet 2011; 43(4): 360-364.

Mutations in NOTCH2 in families with Hajdu-Cheney syndrome - Majewski J, Schwartzentruber JA, Caqueret A, Patry L, Marcadier J, Fryns JP, Boycott KM, Ste-Marie LG, McKiernan FE, Marik I, Van Esch H, FORGE Canada Consortium, Michaud JL, Samuels ME. Mutations in NOTCH2 in families with Hajdu-Cheney syndrome. Hum Mutat 2011; 32(10): 1114-1117.

The case for locus-specific databases - Samuels ME, Rouleau GA. The case for locus-specific databases. Nat Rev Genet 2011; (6): 378-379.

Mutations in a novel serine protease PRSS56 in families with nanophthalmos - Orr A, Dubé MP, Zenteno JC, Jiang H, Asselin G, Evans S, Caqueret A, Lakosha H, Létourneau L, Marcadier J, Matsuoka M, Macgillivray C, Nightingale M, Papillon-Cavanagh S, Perry S, Provost S, Ludman M, Guernsey DL, Samuels ME. Mutations in a novel serine protease PRSS56 in families with nanophthalmos. Mol Vis 2011; 17: 1850-1861.

A mutation in the RNF170 gene causes autosomal dominant sensory ataxia - Valdmanis P, Dupré N, Lachance M, Stochmanski SJ, Belzil VV, Dion PA, Thiffault I, Brais B, Weston L, Saint-Amant L, Samuels ME, Rouleau GA. A mutation in the RNF170 gene causes autosomal dominant sensory ataxia. Brain 2011; 134(Pt 2): 602-607.

Saturation of the human phenome - Samuels ME. Saturation of the human phenome. Curr Genomics 2010; 11(7): 482-499.

Mutation in the gene encoding ubiquitin ligase LRSAM1 in patients with Charcot-Marie-Tooth disease - Guernsey DL, Jiang H, Bédard K, Evans S, Ferguson M, Matsuoka M, Macgillivray C, Nightingale M, Perry S, Rideout A, Orr A, Ludman M, Skidmore D, Benstead T, Samuels ME. Mutation in the gene encoding ubiquitin ligase LRSAM1 in patients with Charcot-Marie-Tooth disease. PLoS Genet 2010; 6(8): e1001081.

Mutations in centrosomal protein CEP152 in primary microcephaly families linked to MCPH4 - Guernsey DL, Jiang H, Hussin J, Arnold M, Bouyakdan K, Perry S, Babineau-Sturk T, Beis J, Dumas N, Evans S, Ferguson M, Matsuoka M, Macgillivray C, Nightingale M, Patry L, Rideout A, Thomas A, Orr A, Hoffmann I, Michaud JL, Awadalla P, Meek DC, Ludman M, Samuels ME. Mutations in centrosomal protein CEP152 in primary microcephaly families linked to MCPH4. Am J Hum Genet 2010; 87(1): 40-51.

De novo mutations in the gene encoding the synaptic scaffolding protein SHANK3 in patients ascertained for schizophrenia - Gauthier J, Champagne N, Lafrenière RG, Xiong L, Spiegelman D, Brustein E, Lapointe M, Peng H, Côté M, Noreau A, Hamdan F, Addington AM, Rapoport JL, Delisi LE, Krebs MO, Joober R, Fathalli F, Mouaffak F, Haghighi P, Néri C, Dubé MP, Samuels ME, Marineau C, Stone EA, Awadalla P, Barker PA, Carbonetto S, Drapeau P, Rouleau GA, S2D team. De novo mutations in the gene encoding the synaptic scaffolding protein SHANK3 in patients ascertained for schizophrenia. Proc Natl Acad Sci USA 2010; 107(17): 7863-7868.

Novel mutations in the sacsin gene in ataxia patients from Maritime Canada - Guernsey DL, Dubé MP, Jiang H, Asselin G, Blowers S, Evans S, Ferguson M, Macgillivray C, Matsuoka M, Nightingale M, Rideout A, Delatycki M, Orr A, Ludman M, Dooley J, Riddell C, Samuels ME. Novel mutations in the sacsin gene in ataxia patients from Maritime Canada. J Neurol Sci 2010; 288(1-2): 79-87.

Mutations in mitochondrial carrier family gene SLC25A38 cause nonsyndromic autosomal recessive congenital sideroblastic anemia - Guernsey DL, Jiang H, Campagna DR, Evans S, Ferguson M, Kellogg MD, Lachance M, Matsuoka M, Nightingale M, Rideout A, Saint-Amant L, Schmidt PJ, Orr A, Bottomley SS, Fleming MD, Ludman M, Dyack S, Fernandez C, Samuels ME. Mutations in mitochondrial carrier family gene SLC25A38 cause nonsyndromic autosomal recessive congenital sideroblastic anemia. Nat Genet 2009; 41(6): 651-653.

Mutations in pyrroline-5-carboxylate reductase 1 gene in families with cutis laxa type 2 - Guernsey DL, Jiang H, Evans S, Ferguson M, Matsuoka M, Nightingale M, Rideout A, Provost S, Bédard K, Orr A, Dubé MP, Ludman M, Samuels ME. Mutations in pyrroline-5-carboxylate reductase 1 gene in families with cutis laxa type 2. Am J Hum Genet 2009; 85(1): 120-129.

[Mutations in the HSN2 exon of WNK1 cause hereditary sensory neuropathy type II] - Rivière JB, Dion P, Shekarabi M, Girard N, Faivre L, Lafrenière RG, Samuels ME, Rouleau GA. [Mutations in the HSN2 exon of WNK1 cause hereditary sensory neuropathy type II]. Méd Sci (Paris) 2009; 25(3): 235-238.

Application of homozygosity haplotype analysis to genetic mapping with high-density SNP genotype data - Jiang H, Orr A, Guernsey DL, Robitaille J, Asselin G, Samuels ME, Dubé MP. Application of homozygosity haplotype analysis to genetic mapping with high-density SNP genotype data. PLoS ONE 2009; 4(4): e5280 (on line).

Phenotypic overlap of familial exudative vitreoretinopathy (FEVR) with persistent fetal vasculature (PFV) caused by FZD4 mutations in two distinct pedigrees - Robitaille JM, Wallace K, Zheng B, Beis MJ, Samuels ME, Hoskin-Mott A, Guernsey DL. Phenotypic overlap of familial exudative vitreoretinopathy (FEVR) with persistent fetal vasculature (PFV) caused by FZD4 mutations in two distinct pedigrees. Ophthalmic Genet 2009; 30(1): 23-30.

Is gene discovery research or diagnosis? - Samuels ME, Orr A, Guernsey DL, Dooley K, Riddell C, Riddell C, Hodgkinson K, Ludman M, Pullman DP. Is gene discovery research or diagnosis?. Genet Med 2008; 10(6): 385-390.

Compound heterozygosity in sodium channel Nav1.7 in a family with hereditary erythermalgia - Samuels ME, Morsche R, Lynch M, Drenth J. Compound heterozygosity in sodium channel Nav1.7 in a family with hereditary erythermalgia. Mol Pain 2008; 4: 21 (on line).

Mutations in the nervous system-specific HSN2 exon of WNK1 cause hereditary sensory neuropathy type II - Shekarabi M, Girard N, Rivière JB, Dion P, Houle M, Toulouse A, Lafrenière RG, Vercauteren F, Hince P, Laganière J, Rochefort D, Faivre L, Samuels ME, Rouleau GA. Mutations in the nervous system-specific HSN2 exon of WNK1 cause hereditary sensory neuropathy type II. J Clin Invest 2008; 118(7): 2496-2505.

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Créée le 22 juillet 2014
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