Le Centre de recherche du CHU Sainte-Justine est affilié à l’Université de Montréal, laquelle figure parmi les 5 universités canadiennes les plus dynamiques en recherche et accueille le deuxième corps étudiant en importance au pays. Ses chercheuses et chercheurs oeuvrent à la Faculté de médecine, à la Faculté de médecine vétérinaire, à la Faculté des arts et sciences et à l'École de santé publique (ESPUM).
D'autres sont aussi professeures ou professeurs à Polytechnique Montréal, l’un des plus importants établissements d’enseignement et de recherche en génie au Canada, ou dans le réseau de l’Université du Québec, qui regroupe 10 établissements universitaires répartis partout au Québec.