Chercheuse ou chercheur

• Études postdoctorales (Whitehead Institute, Massachusetts Institute of Technology), 2023.
• Doctorat en biologie moléculaire (Université de Montréal), 2018.
• 2 années de doctorat en pharmacologie et toxicologie, 24 crédits (University of Connecticut), 2013.
• Maitrise en science : Signalisation et systems intégrés en Biologie (EPHE, Sorbonne Paris), 2011.
• Licence en Génomique (École National de Chimie, Physique et Biologie, Paris), 2009.
• Baccalauréat en sciences techniques en laboratoire, 2006.

Le trouble de l’autisme est une maladie hétérogène touchant environ 1 enfant sur 54 en Amérique du Nord. Les causes de cette maladie neurodéveloppementale restent mal connues et son caractère hétérogène la rend difficile à étudier. Bien que de nombreux progrès aient été réalisés ces dernières années, il reste nécessaire de mieux comprendre quels sont les principaux moteurs de la pathologie. Anthony Flamier mise sur son expérience dans les technologies des cellules souches, CRISPR et le développement neuronal afin de mieux comprendre les régulateurs et marqueurs clés de l’autisme.

• Cellules souches
• CRISPR
• Neurosciences
• Biologie moléculaire

Sommaire de carrière

Entre 2008 et 2011, Anthony Flamier participé à la création de la première unité de cellules souches de la Biopharma Sanofi, où il était en charge de trouver les meilleurs indicateurs de pluripotence par profilage transcriptomique et épigénétique. C'est en 2011 qu'il a commencé à générer de nouvelles lignées hiPSC à partir de patients atteints d'hypercholestérolémie familiale. L'objectif était de développer de nouveaux protocoles pour différencier les hiPSC en hépatocytes fonctionnels, afin de mieux modéliser la maladie in vitro. Ensuite, grâce à l'agrégation des hESC et hiPSC, il a réalisé une évaluation de la tératogénicité potentielle des molécules.

Lors de son doctorat en biologie moléculaire à l'Université de Montréal sous la direction de Gilbert Bernier, Anthony Flamier a étudié le rôle d'une protéine polycomb, BMI1, sur la pathogénicité de la maladie d'Alzheimer (MA). L'objectif était de modéliser la pathologie de la MA in vitro à l'aide de neurones corticaux dérivés d'iPSC et de démontrer le rôle de BMI1 dans l'initiation et la progression de la maladie. 

En 2018, il a réalisé un stage postdoctoral dans le laboratoire du Dr Rudolf Jaenisch à l'institut Whitehead du MIT, afin d'apprendre de nouvelles techniques pour étudier les maladies neurodégénératives et neurodéveloppementales. Depuis, il a développé de nouvelles compétences en édition de gènes, édition épigénétique, robotique, bioinformatique et séquençage de cellule unique. Il a également participé à la réalisation de trois projets de recherche : (1) Sauvetage des syndromes liés à l'X fragile par édition épigénétique dans les neurones des lignées iPSC de patients ; (2) Détection de gènes méthylés différentiellement spécifiques de la MA ; (3) Impact de l'infection par le SRAS-CoV-2 sur les neurones sensoriels dérivés de hiPSC.

Au cours des huit dernières années, il a continuellement développé de nouveaux systèmes de modélisation de maladies (co-culture, cultures 3D, assembloïdes, organoïdes, etc.) afin de mieux récapituler les caractéristiques pathologiques in vitro et répondre à des questions clés.

Laboratoire de recherche

NeuroStem Lab

Prix et distinctions

Présentations orales :

• 2018 - Till and McCulloch stem cell network meeting – Montreal, QC
• 2016 - Annual day of molecular biology – Montreal, QC
• 2015 - FRQS Vision research network 21st annual meeting in the Retina session - Quebec, QC 2015 - Annual meeting of University of Montreal Neurosciences department
• 2014 - FRQS Vision research network 20th annual meeting in the Retina session - Montreal, QC 2014 - Annual Maisonneuve-Rosemont hospital research meeting
• 2014 - Annual day of Medicinal school travel grantees - Montreal, QC
• 2013 - FRQS Vision research network 19th annual meeting in the Retina session - Montreal, QC

Affiches (sélection) :

• 2017 - ISSCR meeting – Boston
• 2013-2017 - Till and McCulloch stem cell network meeting – Canada
• 2014 - Stem Cells and reprogramming international meeting (Keystone) – Olympic Valley, CA, USA

Présentations

• Flamier A, Bisht P, Richards A, Tomasello D, Jaenisch R. Human iPS cell-derived sensory neurons can be infected by SARS-CoV-2 strain WA1/2020 as well as variants delta and omicron. bioRxiv [Preprint]. 2023 Jan 10:2023.01.10.523422. doi: 10.1101/2023.01.10.523422. 
• Zhang L, Bisht P, Flamier A, Barrasa MI, Friesen M, Richards A, Hughes SH, Jaenisch R. LINE1-Mediated Reverse Transcription and Genomic Integration of SARS-CoV-2 mRNA Detected in Virus-Infected but Not in Viral mRNA-Transfected Cells. Viruses. 2023 Feb 25;15(3):629. doi: 10.3390/v15030629.
• Flamier A, El Hajjar J, Adjaye J, Fernandes K, Abdouh M and Bernier G. (2018) Modeling late-onset sporadic Alzheimer's disease through BMI1 deficiency. Cell Reports. doi: 10.1016/j.celrep.2018.04.097.
• Zhou S, Flamier A (co-premier auteur), Abdouh M, Tetreault N, Barabino A, Wadhwa S, and Bernier G (2015). Differentiation of human embryonic stem cells into cone photoreceptors through simultaneous inhibition of BMP/TGFb/WNT signalling. Development. doi: 10.1242/dev.125385.
• Flamier A, Abdouh M, Hamam R, Barabino A, Patel N, Gao A, Hanna R and Bernier G. (2019) Off- target effect of the BMI1 inhibitor PTC596 drives epithelial-mesenchymal transition in glioblastoma multiforme. Nature Precision Oncology. doi: 10.1038/s41698-019-0106-1.

Publications

• Flamier A, Bisht P, Richards A, Tomasello D, Jaenisch R. Human iPS cell-derived sensory neurons can be infected by SARS-CoV-2 strain WA1/2020 as well as variants delta and omicron. bioRxiv [Preprint]. 2023 Jan 10:2023.01.10.523422. doi: 10.1101/2023.01.10.523422. 
• Zhang L, Bisht P, Flamier A, Barrasa MI, Friesen M, Richards A, Hughes SH, Jaenisch R. LINE1-Mediated Reverse Transcription and Genomic Integration of SARS-CoV-2 mRNA Detected in Virus-Infected but Not in Viral mRNA-Transfected Cells. Viruses. 2023 Feb 25;15(3):629. doi: 10.3390/v15030629.
• Hanna R, Flamier A, Barabino A, Bernier G. (2021) G-quadruplexes originating from evolutionary conserved L1 elements interfere with neuronal gene expression in Alzheimer's disease. Nat. Commun. doi: 10.1038/s41467-021-22129-9.
• Flamier A, El Hajjar J, Adjaye J, Fernandes K, Abdouh M and Bernier G. (2018) Modeling late-onset sporadic Alzheimer's disease through BMI1 deficiency. Cell Reports. doi: 10.1016/j.celrep.2018.04.097.
• Barabino A, Flamier A, Hanna R, Heon E, Freedman B and Bernier G. (2020) Deregulation of neuro- developmental genes and primary cilium cystoskeleton anomalies in iPSC retinal sheets from human syndromic ciliopathies. Stem Cell Reports. doi: 10.1016/j.stemcr.2020.02.005.
• Zhou S, Flamier A (co-first author), Abdouh M, Tetreault N, Barabino A, Wadhwa S, and Bernier G (2015). Differentiation of human embryonic stem cells into cone photoreceptors through simultaneous inhibition of BMP/TGFb/WNT signalling. Development. doi: 10.1242/dev.125385.
• Popovic N, Hooker E, Barabino A, Flamier A, Provost F, Bernier G and Larrivee B. (2021) COCO/DAND5 inhibits developmental and pathological ocular angiogenesis. EMBO. doi: 10.15252/emmm.202012005.
• Flamier A, Abdouh M, Hamam R, Barabino A, Patel N, Gao A, Hanna R and Bernier G. (2019) Off- target effect of the BMI1 inhibitor PTC596 drives epithelial-mesenchymal transition in glioblastoma multiforme. Nature Precision Oncology. doi: 10.1038/s41698-019-0106-1.
• Abdouh M, Hanna R, Flamier A, El Hajjar J and Bernier G. (2016) The Polycomb Repressive Complex 1 Protein BMI1 is Required for Constitutive Heterochromatin Formation and Silencing in Mammalian Somatic Cells. Journal of Biological Chemistry. doi: 10.1074/jbc.M115.662403.
• Flamier A, Singh S and Rasmussen TP. (2017) A standardized human embryoid body platform for the detection and analysis of teratogens. PlosONE. doi: 10.1371/journal.pone.0171101.