Chercheuse ou chercheur

Titres

• Professeur adjoint sous contrat, Département de pédiatrie, Université de Montréal (2019)

Laboratoire

Hétérogénéité cellulaire et génomique des cancers

• Postdoctorat, Computational and Systems Biology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, NYC, USA, 2017-2019
• PhD, Biologie moléculaire et biologie des systèmes, Institut de recherche en immunologie et en cancérologie (IRIC), Université de Montréal, Montréal, Canada, 2012-2020 (2022).
• Spécialisation en Hématologie, Université de Montréal, 2010-2012
• Spécialisation en Médecine Interne, Université de Montréal, 2007-2010
• Doctorat en médecine, Université de Montréal, 2002-2007

Les projets de recherche de Dr Lavallée comprennent :

• L’étude de l’hétérogénéité cellulaire dans les cancers pédiatriques, en particulier les leucémies aiguës, afin de mieux comprendre leur développement, leur progression et leurs vulnérabilités.
• La caractérisation des mutations prédisposant aux cancers hématologiques dans la population québécoise, leurs répercussions fonctionnelles et les mécanismes de transformation en cancer.
• Les anomalies de l’hémostase dans les leucémies promyélocytaires aigues et plus particulièrement les bases transcriptomiques qui sous-tendent ces complications.

• Leucémies aiguës
• Prédispositions aux cancers
• Analyses cellules uniques (« single-cell »)
• Génomique des cancers et épigénomique
• Biologie des systèmes
• Bioinformatique

Sommaire de carrière

Vincent-Philippe Lavallée est un clinicien-chercheur ayant obtenu son diplôme de médecine de l’Université de Montréal (2007) où il a ensuite poursuivi une spécialisation en médecine interne (2010) et en hématologie (2012). Il a ensuite entrepris des études supérieures au Ph.D. en biologie moléculaire et biologie des systèmes dans le laboratoire de Dr Guy Sauvageau à l’Institut de recherche en immunologie et cancérologie. Il s’y est penché sur l’étude transcriptomique de différents sous-groupes de leucémies aigues dans le but d’identifier des nouveaux déterminants biologiques, de nouveaux marqueurs pronostiques ainsi que de potentielles cibles thérapeutiques. Il s’est ensuite engagé dans un post-doctorat en biologie computationnelle et biologie des systèmes dans l’équipe de Dre Dana Pe’er au Memorial Sloan Kettering Cancer Center de New York. Il y a utilisé les plus récentes technologies de séquençage à cellules uniques (« single-cell ») pour interroger les profils d’expression (ARN) et épigénétiques (ATAC-seq) de cellules pré-leucémiques et leucémiques afin de mieux comprendre les mécanismes de régulation caractérisant différents ces états cellulaires. La formation complémentaire de Dr Lavallée, marquée par prestigieuse bourse Vanier des IRSC, a mené à de nombreuses publications à titre de premier auteur dans des revues d’impact élevé.

Dr Lavallée a rejoint le service d’hémato-oncologie du CHU Sainte-Justine en 2020 et ses intérêts cliniques portent sur les leucémies aiguës, sur les syndromes de prédisposition aux leucémies ainsi que sur le diagnostic moléculaire en oncologie pédiatrique.

Prix et distinctions

• Memorial Sloan Kettering Cancer Center. Prix de présentation (2018)
• American Society of Hematology, Abstract achievement awards (2018, 2017, 2016, 2015, 2013)
• Fondation Cole. Prix de présentation (2018, 2016, 2015)
• Étudiant chercheur étoile du Fonds de recherche du Québec en Santé. (2016)
• European Hematology society. Bourse de voyage (2014,2016)

Financements majeurs

• Cole Foundation Transition Award
• Genome Canada LSARP
• Bourse d’études supérieures du Canada Vanier
• Bourse de formation de la fondation Cole 

Présentations

• Single-cell expression and chromatin accessibility of pre-leukemia and leukemia cells. Single-Cell Genomics Meeting, Stockholm 2019.
• Single-cell RNA-sequencing mapping of primary acute myeloid leukemias and profiling of NPM1-mutated cells. Single-Cell Genomics Meeting, Broad Institute, Boston, 2018.
• Podoplanin Expression in the Bleeding Complications of Acute Promyelocytic Leukemias. American Society of Hematology, Atlanta, 2017.
• Chemo-transcriptomic analysis of complex karyotype AML reveals increased expression of cell cycle components and exquisite dependency on polo-like kinase. American Society of Hematology, San Diego, 2016.
• Chemo-genomic interrogation of primary acute myeloid leukemia with biallelic CEBPA mutation reveals recurrent CSF3R mutations and subgroup sensitivity to JAK inhibitors European Hematology Society, Copenhague, 2016.

Publications

1. Laughney AM, Hu J, Campbell NR, Bakhoum SF, Setty M, Lavallée VP, Xie Y, Masilionis I, Carr AJ, Kottapalli S, Allaj V, Mattar M, Rekhtman N, Xavier JB, Mazutis L, Poirier JT, Rudin CM, Pe'er D, Massagué J. Regenerative lineages and immune-mediated pruning in lung cancer metastasis. Nat Med. 2020 Feb;26(2):259-269. 
2. Viny AD, Bowman RL, Liu Y, Lavallée VP, Eisman SE, Xiao W, Durham BH, Navitski A, Park J, Braunstein S, Alija B, Karzai A, Csete IS, Witkin M, Azizi E, Baslan T, Ott CJ, Pe'er D, Dekker J, Koche R, Levine RL. Cohesin Members Stag1 and Stag2 Display Distinct Roles in Chromatin Accessibility and Topological Control of HSC Self-Renewal and Differentiation. Cell Stem Cell. 2019 Nov 7;25(5):682-696.e8.
3. Brown CC, Gudjonson H, Pritykin Y, Deep D, Lavallée VP, Mendoza A, Fromme R, Mazutis L, Ariyan C, Leslie C, Pe'er D, Rudensky AY.Transcriptional Basis of Mouse and Human Dendritic Cell Heterogeneity. Cell. 2019 Oct 31;179(4):846-863.e24. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.035. Epub 2019 Oct 24.
4. Moison C,* Lavallée VP*, Thiollier C*, Lehnertz B, Boivin I, Mayotte N, Gareau Y, Fréchette M, Blouin-Chagnon V, Corneau S, Lavallée S, Lemieux S, Marinier A, Hébert J, Sauvageau G. Complex karyotype AML displays G2/M signature and hypersensitivity to PLK1 inhibition. Blood Adv. 2019 Feb 26;3(4):552-563. 
5. Lavallée VP, Chagraoui J, MacRae T, Marquis M, Bonnefoy A, Krosl J, Lemieux S, Marinier A, Pabst C, Rivard GÉ, Hébert J, Sauvageau G. Transcriptomic landscape of acute promyelocytic leukemia reveals aberrant surface expression of the platelet aggregation agonist Podoplanin. Leukemia. 2018 Jun;32(6):1349-1357.
6. Lavallée VP, Krosl J, Lemieux S, Boucher G, Gendron P, Pabst C, Boivin I, Marinier A, Guidos CJ, Meloche S, Hébert J, Sauvageau G.Chemo-genomic interrogation of CEBPA mutated AML reveals recurrent CSF3R mutations and subgroup sensitivity to JAK inhibitors.Blood. 2016 Jun 16;127(24):3054-61. 
7. Lavallée VP, Lemieux S, Boucher G, Gendron P, Boivin I, Armstrong RN, Sauvageau G, Hébert J. RNA-sequencing analysis of core binding factor AML identifies recurrent ZBTB7A mutations and defines RUNX1-CBFA2T3 fusion signature. Blood. 2016 May 19;127(20):2498-501.
8. Lavallée VP, Lemieux S, Boucher G, Gendron P, Boivin I, Girard S, Hébert J, Sauvageau G. Identification of MYC mutations in acute myeloid leukemias with NUP98-NSD1 translocations. Leukemia. 2016 Jul;30(7):1621-4. 
9. Lavallée VP, Baccelli I, Krosl J, Wilhelm B, Barabé F, Gendron P, Boucher G, Lemieux S, Marinier A, Meloche S, Hébert J, Sauvageau G.The transcriptomic landscape and directed chemical interrogation of MLL-rearranged acute myeloid leukemias. Nat Genet. 2015 Sep;47(9):1030-7. doi: 10.1038/ng.3371. Epub 2015 Aug 3. PubMed PMID: 26237430
10. Lavallée VP, Gendron P, Lemieux S, D'Angelo G, Hébert J, Sauvageau G. EVI1-rearranged acute myeloid leukemias are characterized by distinct molecular alterations. Blood. 2015 Jan 1;125(1):140-3.