Chercheur

    Vincent Ferretti , Ph.D.

    vincent.ferretti@recherche-ste-justine.qc.ca
    Vincent Ferretti
    Axe de recherche
    Maladies immunitaires et cancers
    Thème de recherche
    Cancers : mécanismes, nouvelles thérapies et déterminants du pronostic
    Adresse
    CHUSJ - Centre de Recherche

    Téléphone
    514 345-4931 6597

    Titres

    • Professeur-chercheur, Faculté de médecine, Département de biochimie et de médecine moléculaire, Université de Montréal, 2018
    • Directeur, Plateformes numériques, Génome Québec, 2018
    • Chercheur associé, Ontario Institute for Cancer Research, 2018

    Formation

    • Postdoctorat, Centre de recherches mathématiques, Université de Montréal, 1997
    • Ph.D. en mathématiques, Université de Montréal, 1994
    • M.Sc. en mathématiques, Université de Montréal, 1989

    Intérêts de recherche

    Mes intérêts de recherche sont axés sur le développement de méthodes et de logiciels d’analyse bioinformatique du génome visant à identifier et caractériser les variations génétiques responsables des maladies. Mon équipe de bioinformaticiens et d’ingénieurs logiciels applique des technologies de l’information moderne d’analyse des données massives à la recherche en génomique. Elle développe des outils logiciels avancés de traitement, recherche et visualisation à grande échelle des données génomiques dans des environnements de calcul info-nuagiques. Nous travaillons notamment sur la construction de plusieurs projets d’infrastructures de recherche et cliniques dont celles du NIH Gabriella Miller Kids First Data Resource Center, le Centre québécois de données génomiques et le Centre québécois de génomique clinique.

    Expertises de recherche

    • Génomique
    • Bioinformatique
    • Cancer
    • Harmonisation des données
    • Données massives
    • Dévelopement logiciel

    Sommaire de carrière

    Avant de se joindre à Sainte-Justine, Vincent Ferretti était chercheur principal et directeur de la  génomique informatique, au Ontario Institute for Cancer Research (OICR) à Toronto. C’est à ce titre qu’il a participé à de nombreux projets internationaux d’envergure en génomique du cancer. Il a notamment dirigé le développement des infrastructures de l'International Cancer Genome Consortium (ICGC), le NCI Genomic Data Commons, le Cancer Genome Collaboratory et NIH Gabriella Miller Kids First Data Resource Portal. Vincent Ferretti a également dirigé des travaux de recherche sur l’implication des virus dans l’étiologie du cancer. Durant cette même période, Dr Ferretti était co-directeur du programme Maelstrom-Reseach en épidémiologie de l’Institut de recherche du Centre de santé de l’université Mcgill. Avant de se joindre à OICR, Vincent Ferretti était directeur de la bio-informatique au Centre d’innovation de Génome Québec et Université McGill.

    Financements majeurs

    • The Gabriella Miller Kids First Pediatric Data Resource Center, National Institute for Health, 2017-2022
    • Centre québecois de données génomiques, Génome Québec, 2019-2020
    • Cancer Genome Collaboratory, Canadian Funds for Infrastructure, 2018-2021

    Présentations

    • Ferretti V. The ICGC ARGO Data Management Infrastructure. 14th ICGC Scientific Workshop. Paris, France, May 16th, 2018
    • Ferretti V. The ICGC-ARGO project. The GA4GH 5th Plenary Meeting, Orlando, USA, October 16th, 2017
    • Ferretti V. The Cancer Genome Collaboratory, Health Research Alliance Big Data Sharing Meeting, Chicago, USA, September 19th, 2017

    Publications choisies

    • Zhang. J, Bajari R, Andric D, Gerthoffert F., Lepsa A., Nahal-Bose H, Stein L. D., Ferretti V. The International Cancer Genome Consortium Data Portal, Nature Biotechnology, March 2019,  DOI: 10.1038/s41587-019-0055-9
    • Bergeron J, Doiron D, Marcon Y, Ferretti V, Fortier I. Fostering population-based cohort data discovery: The Maelstrom Research cataloguing toolkit. 2018, PLOS ONE 13(7): e0200926.
    • Doiron D, Maron Y, Fortier I, Burton P, Ferretti V, The OBiBa software suite: an open-source solution for epidemiological data management, harmonization and dissemination. International Journal of Epidemiology. September 6, 2017, doi:10.1093/ije/dyx180
    • Jensen MA, Ferretti V, Grossman RL, and Staudt LM, The NCI Genomic Data Commons as an engine for precision medicine, Blood, 2017. blood-2017-03-735654; doi: 10.1182/blood-2017-03-735654
    • Borozan I, Frappier L, Ferretti V, Analysis of Epstein-Barr Virus Genomes and Expression Profiles in Gastric Adenocarcinoma, Journal of Virology,  JVI.01239-17, 2017.
À propos de cette page

Créée le 22 juillet 2014
Signaler ou faire une remarque
 

Chaque dollar compte !

Merci de votre générosité.

Ce sont les donateurs comme vous qui nous permettent d’accélérer la recherche, de guérir, à chaque année, plus d’enfants et continuer d’offrir un des meilleurs niveaux de santé au monde.

Il est également possible de donner par la poste ou de donner par téléphone au numéro sans frais

1-888-235-DONS (3667)

Nous contacter

514 345-4931

Légal

© 2006-2014 Centre de recherche du CHU Sainte-Justine.
Tous droits réservés.
Avis légaux  Confidentialité  Sécurité

Avertissement

Les informations contenues dans le site « CHU Sainte-Justine » ne doivent pas être utilisées comme un substitut aux conseils d’un médecin dûment qualifié et autorisé ou d’un autre professionnel de la santé. Les informations fournies ici le sont à des fins exclusivement éducatives et informatives.

Consultez votre médecin si vous croyez être malade ou composez le 911 pour toute urgence médicale.

CHU Sainte-Justine