La plateforme de protéomique est dotée d’un spectromètre de masse de dernière génération Orbitrap Eclipse Tribrid équipé d’un module FAIMS, le premier du genre au Canada, permettant un programme novateur pour la découverte d'antigènes tumoraux dans le contexte du développement de nouvelles stratégies immunothérapeutiques contre le cancer.
La plateforme a récemment été financée par une subvention de la Fondation canadienne pour l'innovation. Ainsi, la plateforme pourra se développer vers une expertise multi-omique basée sur la spectrométrie de masse pour favoriser les services et les collaborations à travers la communauté dans les différents axes de recherche. La plateforme fournit des résultats de haute qualité et une expertise dans la planification, la conception, l'exécution et l'analyse des données, rendant le domaine des « omiques » accessible.
Instrument
- Thermo Orbitrap Eclipse Tribrid- module FAIMS
Services offerts
IMMUNOPEPTIDOMIQUE EXPLORATOIRE ET CIBLÉE
- Plateforme multi-omique intégrant la prédiction, l’identification et la validation de néoantigènes par spectrométrie de masse en tandem;
- Analyse de tout type d’échantillon (tissus, tumeurs, lignées cellulaires, plasma);
- Collection de 35 lignées cellulaires HLA mono-alléliques transgéniques, adaptables pour validation et quantification de néoantigènes;
- Service d’évaluation d'affinité d'anticorps dirigés contre des néoantigènes.
PROTÉOMIQUE EXPLORATOIRE ET CIBLÉE
- Protéomique plasmatique et urinaire (humain, de souris, ou PDX);
- Identification de biomarqueurs protéiques solubles et protéines associées aux vésicules extracellulaires (EVs, exosomes, nanovésicules);
- Quantification de biomarqueurs protéiques ou peptidiques ciblée et/ou absolue.
Clientèle
Milieu académique et compagnies pharmaceutiques et biotechnologiques souhaitant obtenir un service d’analyses protéomiques.
Partenaires financiers
- Fondation Charles-Bruneau
- Fonds Grandir en santé
- Fondation canadienne pour l'innovation
- Fondation CHU Sainte-Justine
Équipe
Personne-ressource principale
Isabelle Sirois PhD
514 345-4931, poste 5199
isabelle.sirois.hsj@ssss.gouv.qc.ca
Autres personnes-ressources
Marc-André Déry PhD
514 345-4931, poste 7396
marc-andre.dery.hsj@ssss.gouv.qc.ca
Valérie Villeneuve
Responsable des plateformes communes
514 345-4931, poste 2786
valerie.villeneuve.hsj@ssss.gouv.qc.ca
Publications associées à la Plateforme de protéomique et d'immunopeptidomique